При институционалното оценяване от НАОА получените акредитационни оценки са следните за трите университета с най-висока акредитационна оценка както следва:
1. Медицински университет-София
Институционална акредитация с оценка: 9,68 от 25.07.2013 г. за срок от шест години
2. Университет за национално и световно стопанство
Институционална акредитация с оценка 9,65 от 19.07.2012 г. за срок от шест години
3. Софийски университет „Св. Климент Охридски“
Институционална акредитация с оценка 9,59 от 25.10.2012 г. за срок от шест годин
