Общото събрание /ОС/ е висш орган на управление. ОС има 400 члена и включва представители на академичния състав, редовни докторанти, студенти и административен персонал.
ОС има следните правомощия:
Приема и изменя Правилника за устройството и дейността на МУ-София
Избира за срока на мандата си председател и зам. председател
Утвърждава политиката, основните насоки и приоритетите за развитие на университета, както и плановете за действие
Избира ректора на МУ-София
Определя структурния и числен състав на АС
Определя броя и членовете на Контролния съвет /КС/ и избира за срока на мандата председател, зам. председател и членове на КС
Обсъжда и приема годишния доклад на ректора за състоянието на университета